Σχεδιάζονται πειράματα μικρο-εργαστηριακής-κλίμακας όπου μελετώνται οι μηχανισμοί που διέπουν τις βιολογικές και ηλεκτροχημικές διεργασίες. Οι διεργασίες αυτές περιγράφονται στη συνέχεια με μαθηματικά μοντέλα ώστε να υπάρχει η δυνατότητα πρόβλεψης και η ικανότητα σχεδιασμού διεργασιών. Κατόπιν αναπτύσσονται πιλοτικά συστήματα στο Εργαστήριο όπου επαληθεύονται / επιβεβαιώνονται οι προβλέψεις των μοντέλων και αντιμετωπίζονται τα λειτουργικά προβλήματα της μεγαλύτερης κλίμακας.

Τέλος, σχεδιάζονται και κατασκευάζονται βιομηχανικά συστήματα ώστε να δοκιμαστούν στην πράξη τα αποτελέσματα της ερευνητικής προσπάθειας. Ο τρόπος αυτός λειτουργίας του Εργαστηρίου έχει αποδειχθεί ιδιαίτερα πετυχημένος καθώς προσφέρει πολλά εφόδια στους εκπαιδευόμενους σε αυτό, αποτελεί μια ολοκληρωμένη προσπάθεια με σημαντικά αποτελέσματα και φέρνει με επιτυχία σε επαφή την ερευνητική δραστηριότητα με τα κοινωνικά / περιβαλλοντικά προβλήματα.